西葫芦种子栽培化瓜是生产上较常见的问题。化瓜，指西葫芦雌花开放后3-4天内，幼果前面部分褪绿变黄，变细变软，果实不膨大或膨大很少，表面失去光泽，先端萎缩，不能形成商品瓜，最终烂掉或脱落的现象。目前，西葫芦化瓜已成为生产障碍因素之一，主要有以下类型：
（1）徒长型化瓜
多为氮肥用量偏多、浇水早、水量大、夜温高等原因造成瓜秧旺长，子房很小，开花后即使人工授粉和2,4-滴点花，幼瓜也很少膨大，最终黄萎化掉。多出现在初瓜期。防止这种化瓜，首先要控水，白天加大通风量，草苫适当晚盖，降低夜温。棚膜保持清洁。叶面喷施0.3%磷酸二氢钾溶液，抑制叶片徒长。
（2）老化型化瓜
土壤干旱、植株衰老，叶片暗绿无光泽，开花后不久幼瓜即萎黄。防治老化型化瓜应及时浇水，适当提高温室的温度，及时疏瓜，尤其是根瓜要早摘，防止根瓜堕秧造成前部大量化瓜。
（3）养分争夺型化瓜
留瓜过多，致使因养分争夺而大批化掉。因此要根据植株长势和叶面积大小留瓜，一般在10叶前留1-2个即可。土质肥沃，瓜秧健壮的可适当多留，但要及时采收，一般达到300克即可，严防大瓜堕秧。
（4）温度失调型化瓜
深冬剧烈降温或遇到长时间连阴天，以及春季放风不及时、高温造成秧子早衰等均会造成大批化瓜。防治措施主要是调节好温度，冬季要加强温室的增光、增温、保温工作。春季应及时通风，严防出现30℃以上的高温。一般白天保持18-22℃，夜间8-12℃，化瓜少，产量高，商品瓜外表鲜嫩而有光泽。
（5）病理性化瓜
主要是灰霉病引起的化瓜。连阴天、大水漫灌、低温高湿最容易引起灰霉病的发生和蔓延。防治措施为：整地前认真清理前茬作物，做好空间和土壤消毒。进行高垄栽培，地膜覆盖，宽行稀植，立架栽培。防止大水漫灌，温度许可时加大通风量，降低湿度。初花期开始，用百菌清烟剂和腐霉利烟剂交替熏蒸，7-10天一次。当雌花开放2-3天后，幼果已坐住时若发现残花湿烂，应及时摘除并用草木炭涂抹幼果先端。对灰霉病普遍发生造成严重化瓜的温室，要把所有西葫芦病瓜摘除，在温室外深埋，加大通风量，降低湿度，用50%腐霉利2000倍液或异菌脲1000倍液全棚喷洒，夜间可用百菌清烟剂熏蒸。